CT ühendamine kaitsereleega erineb mõõtmisrakendustest mitmel olulisel viisil. Kaitsereleed nõuavad kindlate täpsusklassidega CT-sid, mis on ette nähtud lineaarseks toimimiseks rikkeolukorras, kui primaarvoolud võivad olla nimiväärtusest mitu korda suuremad. CT sekundaarvoolik peab olema ühendatud relee voolusisendi klemmidega õige polaarsusega, et tagada õige suuna- ja diferentsiaalkaitse töö.
Sekundaarsed ühendused S1 ja S2 tuleks ühendada relee klemmidega, mis on lülitusskeemil vastavalt tähistatud k ja l -. Diferentsiaalkaitseskeemide puhul on polaarsuse joondamine kriitiline. Kaitseseadme mõlemale küljele sisenevaid voolusid tuleb arvestada nende suunaga. Kui rike ilmneb tegelikus töös, peab relee suutma eristada sisemisi rikkeid ja läbivigusid ning see eristamine sõltub täielikult õigest CT polaarsusest ja ühendusest.
Trafo diferentsiaalkaitses peab CT-de ühendamine arvestama jõutrafo mähise konfiguratsioonist tulenevat faasinihet. Kui primaartrafo mähis on delta{1}}ühendatud, on primaarmuundurid tavaliselt ühendatud tähega; kui sekundaartrafo mähis on täht-ühendatud, on sekundaarsed CT-d ühendatud kolmnurkselt. See kompenseerib 30-kraadise faasinihke ja tagab, et releesse sisenevad voolud on tavatingimustes faasis-. Keerulisemate olukordade korral võib vajaliku suhte ja faasikorrektsiooni saavutamiseks kasutada väliseid interposing-voolutrafosid (ICT).
Maandustõkete kaitseskeemid sõltuvad ka konkreetsetest CT-ühendustest. Otsene relee võib pakkuda maandatud-faasikaitset, kasutades CT-d suhtega 50/5 või 10/1. Tasakaalu voo relee tuvastab maandatud-faasivoolu, kasutades sõõrik-tüüpi CT-d, mis on paigaldatud kolme faasijuhtme ümber, kus voolude summa peaks tavaliselt olema null. Jääkväljalülituse relee kasutab kolmefaasilisest CT-st saadud rikkevoolu.
Sõltumata kaitseskeemist kehtivad samad põhilised ohutusreeglid: CT sekundaarvoolu ei tohi primaarvoolu voolamise ajal kunagi lahti jätta ja sekundaarahel peab olema ühes punktis maandatud. Enne juhtmestiku ühendamist tuleks CT sekundaar{1}}pingest vabastada, lühistades selle lühisploki kaudu. Kõik välise voolutrafo sekundaarmähised peavad olema maandatud maandussiiniga ja mitte mingil juhul ei tohi CT sekundaarmähiseid jätta avatuks-, kui primaarvool voolab. Pärast paigaldamist kontrollige polaarsust, jälgides relee mõõdetud voolusid koormuse all või kasutades kasutuselevõtu ajal faasi-nurgamõõturit.